30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4272 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4272  membrane protein-like protein  100 
 
 
478 aa  965    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0853  membrane protein-like protein  30.55 
 
 
579 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691101  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3886  membrane protein-like protein  30.78 
 
 
586 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.920923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  25.76 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  24.95 
 
 
463 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  24.95 
 
 
463 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  24.48 
 
 
520 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  25.54 
 
 
498 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  25.12 
 
 
463 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  25.12 
 
 
463 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0720  hypothetical protein  26.49 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  24.44 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4049  hypothetical protein  23.97 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1053  membrane protein-like protein  27.29 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150253  hitchhiker  0.00944494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  24.89 
 
 
659 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1526  hypothetical protein  22.04 
 
 
546 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  24.38 
 
 
489 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  25.42 
 
 
470 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26411  hypothetical protein  26.6 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1179  hypothetical protein  20.64 
 
 
509 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  22.55 
 
 
465 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  26.2 
 
 
509 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  21.88 
 
 
663 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0322  hypothetical protein  24.79 
 
 
548 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  26.76 
 
 
481 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1992  hypothetical protein  27.27 
 
 
283 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1336  membrane protein-like protein  22.7 
 
 
785 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2372  hypothetical protein  24.45 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7352  putative integral membrane protein  23.38 
 
 
563 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  29.35 
 
 
494 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>