More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3219 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
793 aa  1637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  60.08 
 
 
1171 aa  311  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  57.85 
 
 
1335 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  57.09 
 
 
740 aa  284  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  55.74 
 
 
1237 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.22 
 
 
619 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  54.47 
 
 
650 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  57.59 
 
 
247 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  64.43 
 
 
345 aa  280  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  54.07 
 
 
649 aa  280  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  60.68 
 
 
212 aa  272  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  60.51 
 
 
308 aa  258  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  63.33 
 
 
351 aa  253  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  52.94 
 
 
547 aa  249  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1237  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 
286 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  41.37 
 
 
553 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.72 
 
 
367 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  47.18 
 
 
651 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 
471 aa  183  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  41.39 
 
 
1333 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.03 
 
 
347 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
363 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  39.58 
 
 
550 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  41.98 
 
 
1313 aa  180  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1491  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0411849  normal  0.405552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
348 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 
347 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
713 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  46.23 
 
 
320 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3014  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
513 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
513 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2868  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
513 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.35 
 
 
357 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
438 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01215  Response regulator  39.5 
 
 
509 aa  172  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
357 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 
357 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 
491 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 
387 aa  171  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  26.14 
 
 
836 aa  170  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2755  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
520 aa  170  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 
350 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 
320 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 
420 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 
496 aa  169  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  36.58 
 
 
548 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  34.9 
 
 
632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  45.41 
 
 
349 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
698 aa  168  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.41 
 
 
357 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.17 
 
 
880 aa  167  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.17 
 
 
860 aa  167  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
348 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
371 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 
861 aa  165  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 
868 aa  165  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
465 aa  165  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2546  metal-dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 
515 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
1073 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
512 aa  163  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
513 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.74 
 
 
508 aa  162  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
353 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 
710 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 
394 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.45 
 
 
344 aa  161  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.14 
 
 
346 aa  161  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
487 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
526 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
371 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
718 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
407 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1019  putative response regulator  35.68 
 
 
522 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 
373 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 
719 aa  157  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.77 
 
 
432 aa  157  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
357 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
420 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 
539 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 
375 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  24.89 
 
 
771 aa  156  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
523 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 
375 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 
339 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  47.19 
 
 
252 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  44.24 
 
 
545 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.21 
 
 
1079 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 
615 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
366 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.84 
 
 
331 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.84 
 
 
331 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 
505 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  45.09 
 
 
384 aa  155  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
692 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
703 aa  155  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
391 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.89 
 
 
367 aa  154  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2799  metal-dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
422 aa  154  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0938025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  41.04 
 
 
212 aa  154  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>