More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1349 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  96.6 
 
 
470 aa  875    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  100 
 
 
468 aa  954    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  43.79 
 
 
479 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  41.49 
 
 
466 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  39.91 
 
 
435 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  39.27 
 
 
445 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  36.05 
 
 
495 aa  255  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  36.05 
 
 
495 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  36.67 
 
 
445 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  36.38 
 
 
481 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  33.96 
 
 
436 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  37.26 
 
 
427 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  32.21 
 
 
463 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  30.22 
 
 
628 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  32.13 
 
 
1199 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  29.55 
 
 
418 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.72 
 
 
418 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  33 
 
 
1274 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  30.7 
 
 
433 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  34.18 
 
 
999 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  30.24 
 
 
446 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  28.01 
 
 
657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.32 
 
 
429 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  28.33 
 
 
413 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.91 
 
 
420 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  30.97 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  28.97 
 
 
417 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.64 
 
 
536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.45 
 
 
496 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  28.12 
 
 
415 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  29.53 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  27.3 
 
 
425 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  26.09 
 
 
577 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.17 
 
 
625 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
470 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  26.34 
 
 
422 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 
474 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  27.03 
 
 
480 aa  106  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.84 
 
 
624 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  26.18 
 
 
485 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  27.83 
 
 
419 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  27.91 
 
 
409 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  28.81 
 
 
422 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  27.51 
 
 
422 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  27.6 
 
 
414 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.05 
 
 
436 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  27.18 
 
 
456 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  27.51 
 
 
442 aa  100  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  28.57 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.76 
 
 
592 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  27.89 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  22.94 
 
 
565 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.38 
 
 
619 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.38 
 
 
619 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.21 
 
 
449 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.12 
 
 
616 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  27.82 
 
 
413 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  28.2 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  27.25 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  27.16 
 
 
430 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  27.97 
 
 
447 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.23 
 
 
451 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  25.8 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  27.25 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.09 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.6 
 
 
484 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  27.73 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  25.42 
 
 
463 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
476 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.27 
 
 
494 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.37 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.09 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  26.09 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.02 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.05 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.39 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  24.5 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  25.91 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.73 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.37 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.58 
 
 
490 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  28.87 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.43 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 
504 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.03 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  22.3 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  24.42 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  25.66 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.1 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.71 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.9 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.86 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.43 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  24.95 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  26.1 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.95 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>