More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1223 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  100 
 
 
589 aa  1203    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  37.32 
 
 
594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  33.45 
 
 
622 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  32.05 
 
 
558 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
558 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 
590 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
541 aa  209  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.82 
 
 
532 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
552 aa  203  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 
530 aa  203  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 
545 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
532 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
543 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  28.73 
 
 
526 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
532 aa  197  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 
538 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
535 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
531 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
530 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
545 aa  194  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  29.26 
 
 
555 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
544 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  27.8 
 
 
554 aa  190  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
532 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  28.37 
 
 
530 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
522 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
549 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
535 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  27.98 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  28.15 
 
 
541 aa  180  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  27.9 
 
 
559 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
544 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 
528 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.94 
 
 
558 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  28.17 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  28.17 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
528 aa  174  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.74 
 
 
536 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
534 aa  173  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.7 
 
 
520 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.73 
 
 
545 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
554 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
534 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
533 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  27.98 
 
 
537 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
538 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  28.57 
 
 
530 aa  170  6e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.47 
 
 
543 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
531 aa  170  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.28 
 
 
537 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  27.7 
 
 
537 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  27.5 
 
 
537 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3293  ABC transporter substrate-binding protein  26.7 
 
 
567 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00121991  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  27.31 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1894  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3270  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  27.31 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2041  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2073  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.25 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1856  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  26.25 
 
 
553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.882448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2031  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.08 
 
 
553 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3379  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.89 
 
 
562 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2142  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.41 
 
 
553 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3645  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.89 
 
 
562 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3278  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.91 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  27.11 
 
 
537 aa  165  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
552 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
523 aa  165  3e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3272  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
567 aa  165  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00124689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.25 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834356  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  27.11 
 
 
537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1621  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.21 
 
 
567 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00066622  hitchhiker  0.00438067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
526 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
536 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>