More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0980 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  720    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  63.31 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.01 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  54.44 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  56.85 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.73 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  52.59 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  52.3 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.05 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  58.41 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  52.37 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.3 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 358 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.14 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 359 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 		 363 aa  358  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 354 aa  358  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>