34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0919 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0919  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1023 aa  2100    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3106  PKD domain containing protein  36.8 
 
 		 989 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3228  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 991 aa  568  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0921  hypothetical protein  82.69 
 
 		 1160 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3102  PKD domain containing protein  37.02 
 
 		 1132 aa  98.6  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1017 aa  92.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3233  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 1067 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0173325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.35 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  25.63 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  34.65 
 
 		 1565 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.72 
 
 		 1150 aa  53.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.34 
 
 		 816 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  41.1 
 
 		 712 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.57 
 
 		 623 aa  50.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0426  cytochrome c family protein  24.06 
 
 		 916 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  37.07 
 
 		 778 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  37.07 
 
 		 778 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  31.33 
 
 		 400 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  37.07 
 
 		 778 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  39.73 
 
 		 2066 aa  49.3  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  37.07 
 
 		 778 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.47 
 
 		 1057 aa  48.5  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  38.26 
 
 		 775 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  40.62 
 
 		 734 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  28.76 
 
 		 945 aa  46.2  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.91 
 
 		 938 aa  46.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.14 
 
 		 3197 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.11 
 
 		 677 aa  45.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  36.67 
 
 		 1606 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  32.9 
 
 		 998 aa  45.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1916 aa  45.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  50 
 
 		 884 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  43.1 
 
 		 873 aa  45.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.01 
 
 		 792 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>