167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0852 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0852  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0139574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2759  hypothetical protein  73.37 
 
 
323 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  69.54 
 
 
316 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  68.39 
 
 
316 aa  250  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3251  hypothetical protein  68.64 
 
 
315 aa  248  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0119  hypothetical protein  65.14 
 
 
316 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  61.76 
 
 
316 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3214  hypothetical protein  59.12 
 
 
324 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0395  hypothetical protein  56.9 
 
 
370 aa  203  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1323  protein of unknown function DUF523  55.36 
 
 
323 aa  203  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.467968  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2712  hypothetical protein  54.24 
 
 
315 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  54.22 
 
 
314 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1786  protein of unknown function DUF523  54.44 
 
 
335 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.505701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2060  protein of unknown function DUF523  55.88 
 
 
316 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2532  hypothetical protein  55.49 
 
 
316 aa  187  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1933  hypothetical protein  50 
 
 
311 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0799437  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3008  hypothetical protein  48.26 
 
 
318 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.728517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3126  protein of unknown function DUF523  48.84 
 
 
318 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3227  protein of unknown function DUF523  48.84 
 
 
318 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.994615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  49.12 
 
 
319 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1208  hypothetical protein  51.79 
 
 
326 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.569232  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1609  protein of unknown function DUF523  48.48 
 
 
319 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001250  hypothetical protein  44.77 
 
 
316 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.618518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05120  hypothetical protein  47.53 
 
 
316 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1073  hypothetical protein  48.8 
 
 
316 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.531522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4734  hypothetical protein  47.13 
 
 
320 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  47.16 
 
 
326 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1123  hypothetical protein  46.11 
 
 
318 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0865  hypothetical protein  44.1 
 
 
314 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2662  hypothetical protein  45.18 
 
 
318 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0322791  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0963  hypothetical protein  45.51 
 
 
318 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2713  hypothetical protein  47.62 
 
 
324 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1153  hypothetical protein  42.53 
 
 
326 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580945  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0997  hypothetical protein  43.93 
 
 
318 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3010  hypothetical protein  41.95 
 
 
315 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4454  protein of unknown function DUF523  41.76 
 
 
332 aa  141  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0082  hypothetical protein  42.42 
 
 
322 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0126049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0394  hypothetical protein  43.71 
 
 
332 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  42.37 
 
 
322 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  46.63 
 
 
319 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1610  protein of unknown function DUF1722  42.68 
 
 
321 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  42.94 
 
 
322 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  43.71 
 
 
322 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3386  hypothetical protein  41.92 
 
 
317 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2716  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  43.26 
 
 
319 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0810  hypothetical protein  43.71 
 
 
317 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41400  hypothetical protein  42.94 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.476626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1251  hypothetical protein  44.17 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1163  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1234  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1164  hypothetical protein  41.32 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3056  hypothetical protein  40.72 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1307  Protein of unknown function DUF1722  40.72 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.538615  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3213  hypothetical protein  40.72 
 
 
317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  41.81 
 
 
322 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3070  hypothetical protein  40.72 
 
 
317 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2778  hypothetical protein  41.86 
 
 
314 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3039  hypothetical protein  40.12 
 
 
320 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1612  hypothetical protein  40.36 
 
 
315 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2839  hypothetical protein  40.35 
 
 
320 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  45.4 
 
 
319 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5307  hypothetical protein  42.94 
 
 
318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61610  hypothetical protein  44.31 
 
 
319 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  44.79 
 
 
317 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1478  hypothetical protein  41.28 
 
 
314 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1174  protein of unknown function DUF523  43.11 
 
 
319 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0062  hypothetical protein  42.42 
 
 
319 aa  118  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1648  hypothetical protein  43.64 
 
 
319 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032015  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0012  putative pathogenicity island protein  42.42 
 
 
319 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1523  putative pathogenicity island protein  40 
 
 
319 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1502  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000133408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1953  putative inner membrane protein  40 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1782  putative pathogenicity island protein  40 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1486  putative pathogenicity island protein  40 
 
 
319 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487768  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1379  hypothetical protein  38.1 
 
 
319 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1863  hypothetical protein  35.29 
 
 
332 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00685255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1150  protein of unknown function DUF523  34.97 
 
 
315 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.441382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2241  hypothetical protein  37.2 
 
 
345 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4334  protein of unknown function DUF523  36.97 
 
 
327 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.928853  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2368  hypothetical protein  40.12 
 
 
322 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0991526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2326  hypothetical protein  40.12 
 
 
322 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.408267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2546  hypothetical protein  40.12 
 
 
322 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04980  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2602  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2510  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2559  hypothetical protein  38.95 
 
 
322 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.39959e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2547  hypothetical protein  37.79 
 
 
322 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2354  hypothetical protein  38.92 
 
 
322 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.686451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2813  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1381  protein of unknown function DUF523  39.26 
 
 
312 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2284  hypothetical protein  38.37 
 
 
322 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0716  Protein of unknown function DUF1722  32.53 
 
 
311 aa  95.5  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000994738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0380  hypothetical protein  32.3 
 
 
322 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1500  hypothetical protein  33.54 
 
 
333 aa  92  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0478  hypothetical protein  33.13 
 
 
327 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2140  Protein of unknown function DUF1722  34.91 
 
 
339 aa  92  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1655  Protein of unknown function DUF1722  33.74 
 
 
316 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0536  hypothetical protein  30.82 
 
 
322 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.037048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1601  hypothetical protein  31.06 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0115069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>