More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0407 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  45.77 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  47.76 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  44.22 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  44.34 
 
 		 235 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  44.66 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  42.79 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  46.11 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  42.79 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  44.34 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  44.34 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  41.59 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  42.31 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  48.66 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.53 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  47.87 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  40.25 
 
 		 259 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  46.84 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  42.36 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  44.15 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  45.21 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  39.5 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  38.02 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  37.1 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  42.46 
 
 		 825 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  43.43 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  41.21 
 
 		 827 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  40.1 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  40.1 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  41.29 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  36.65 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  39.13 
 
 		 819 aa  118  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  43.62 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  38.86 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  34.54 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  37.14 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  39.57 
 
 		 832 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  32.99 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  39.08 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.71 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.63 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  38.02 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.38 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  36.78 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.6 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.98 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.78 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  36.78 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.78 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.94 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.87 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.21 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.21 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  32.49 
 
 		 198 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  48.74 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  39.7 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.46 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.38 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  31.77 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  34.01 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.41 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  35.2 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  33.68 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.94 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.11 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.11 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  32.02 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.63 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.71 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.13 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  32.96 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  33.85 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0644  quinol oxidase, subunit III  29.29 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.244808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  36.08 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  38.51 
 
 		 295 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  32.64 
 
 		 219 aa  97.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  33.85 
 
 		 212 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  29.71 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  35.63 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.6 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  32.78 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.69 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.46 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  35.26 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.22 
 
 		 298 aa  96.7  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>