50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0354 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  92.38 
 
 		 105 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  40.57 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  40.78 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  39.62 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  39.42 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  30.39 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0737  nucleotidyltransferase  32.5 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.86 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  37.86 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  37.86 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.65 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.54 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  32.67 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  32.69 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.69 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  31.4 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  47.83 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  40.28 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  51.22 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  31.13 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  35.16 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  37.5 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  34.29 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  27.66 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 96 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>