237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4543 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 412 aa  802    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.41 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  40.53 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  42.82 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  42.08 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  40.16 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  37.99 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  36.9 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.67 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  34.72 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  35.08 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  36.09 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  35.93 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  35.28 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  32.74 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.16 
 
 		 399 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.18 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  36.39 
 
 		 381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 		 376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  35.41 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  32.66 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.89 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  36.41 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  34.63 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  34.29 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  32.86 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  32.25 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  33.97 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.68 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  34.76 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.58 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  32.31 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  32.57 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  33.65 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.42 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  33.98 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  33.15 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  32.78 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  30.52 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  36.06 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  34.1 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  34.36 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  32.48 
 
 		 369 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.85 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.69 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  30.46 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  32.69 
 
 		 371 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  32.69 
 
 		 371 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  32.3 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.42 
 
 		 371 aa  143  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  32.42 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  32.42 
 
 		 371 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.63 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  27.2 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  32.9 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.71 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  31.29 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  30.86 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  30.58 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  34.36 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  32.41 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  31.01 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.2 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  33 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.55 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.57 
 
 		 360 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>