182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4165 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
357 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  63.78 
 
 
348 aa  354  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  45.31 
 
 
346 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  43.21 
 
 
330 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  40.19 
 
 
337 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  38.94 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  38.49 
 
 
336 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.95 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
424 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  39.69 
 
 
348 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  38.21 
 
 
374 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 
435 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  37.72 
 
 
337 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  40.84 
 
 
334 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  36.7 
 
 
379 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  36.02 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  35.56 
 
 
400 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 
373 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  34.16 
 
 
335 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 
364 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.9 
 
 
332 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  33.74 
 
 
345 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  33.92 
 
 
362 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
373 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  29.49 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  27.61 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.81 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.55 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.56 
 
 
622 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.14 
 
 
631 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.42 
 
 
568 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.35 
 
 
723 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.56 
 
 
622 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.82 
 
 
643 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 
664 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  35.82 
 
 
581 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.65 
 
 
595 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  32.47 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.87 
 
 
642 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.76 
 
 
598 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.09 
 
 
738 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 
738 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 
667 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 
652 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  31.76 
 
 
603 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
746 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 
647 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
1046 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 
648 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
1065 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  25.97 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
597 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
1130 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
626 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
1133 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  28.75 
 
 
518 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
273 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  31.41 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.43 
 
 
611 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
1123 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
273 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
647 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  31.98 
 
 
1122 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  22.48 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
658 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
273 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1089 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.14 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
667 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.54 
 
 
614 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
304 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
647 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
275 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.54 
 
 
596 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.41 
 
 
634 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
295 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.54 
 
 
584 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
633 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  24.06 
 
 
546 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
471 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>