145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3979 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  62.71 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.7 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  56.17 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  56.83 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  56.83 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  56.83 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  64.35 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  53.78 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.47 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  55.61 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  57.87 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  53.15 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  54.67 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  42.5 
 
 		 374 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  41.63 
 
 		 376 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  41.7 
 
 		 357 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.3 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  42.79 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.5 
 
 		 376 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  43.72 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  41.53 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.47 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  44.95 
 
 		 343 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.77 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  42.68 
 
 		 371 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  44.09 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  44.16 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  35.37 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  39.57 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  39.21 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  40.97 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  39.82 
 
 		 372 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  39.81 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  35.32 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.27 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.82 
 
 		 372 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  42.98 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  41.92 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  36.91 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.51 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.91 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  40.53 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  35.35 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  39.5 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  40.38 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  42.78 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  40.08 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  38.86 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  39.3 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  28.09 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  31.36 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  27.9 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.93 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  40.83 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  36.96 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  39.06 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.02 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.56 
 
 		 371 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  37.97 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.48 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  39.13 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  43.23 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.56 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.58 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  38.7 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  42.58 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  39.82 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  37.24 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  36.43 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.61 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  38.06 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.32 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  42.51 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  41.74 
 
 		 383 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.43 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  38.64 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  30.73 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  32.72 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  32.72 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  41.38 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  47.24 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.24 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  27.46 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  32.34 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  41.38 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  42.11 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  32.23 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  34.6 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  46.3 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  36.75 
 
 		 365 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.35 
 
 		 360 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.74 
 
 		 399 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.17 
 
 		 389 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  32.27 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.81 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.96 
 
 		 401 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>