291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2791 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  64.83 
 
 		 497 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 505 aa  1007    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  70.78 
 
 		 497 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  65.98 
 
 		 492 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  69.82 
 
 		 497 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  60.44 
 
 		 503 aa  581  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  60.04 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.04 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.04 
 
 		 472 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.46 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.83 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  46.34 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.68 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  48.46 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  47.63 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.25 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  46.94 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  45.4 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.68 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  44.18 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  44.51 
 
 		 493 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  48.58 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.01 
 
 		 659 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  48.87 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  46.07 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  45.04 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  45.6 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  46.53 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  44.6 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.59 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.83 
 
 		 589 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.44 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  46.33 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.08 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.78 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  43.7 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.94 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.07 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  45.86 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  48.46 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  42.8 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  42.8 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.8 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  42.8 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  42.8 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  42.8 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  43.63 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  39.71 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  41.36 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  42.59 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  41.56 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  42.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  44.85 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  44.31 
 
 		 499 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.95 
 
 		 488 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  42.06 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.74 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.74 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.74 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.74 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.74 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  43.54 
 
 		 486 aa  360  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  42.86 
 
 		 490 aa  359  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.1 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.57 
 
 		 495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  43.01 
 
 		 486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  44.69 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.69 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  43.01 
 
 		 486 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 		 509 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.37 
 
 		 495 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  43.12 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  43.12 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  43.12 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 		 486 aa  353  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  42.92 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.75 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  43.06 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.38 
 
 		 486 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  41.89 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  41.75 
 
 		 490 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  41.55 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  39.37 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41.55 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  41.34 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  41.34 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.42 
 
 		 505 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.73 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  41.54 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.3 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  41.3 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  41.49 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.87 
 
 		 509 aa  338  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.24 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.76 
 
 		 488 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.6 
 
 		 493 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.98 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.61 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.61 
 
 		 488 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>