99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2140 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
207 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  54.5 
 
 
204 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  42.79 
 
 
298 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  40.51 
 
 
329 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  37.88 
 
 
348 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  39.18 
 
 
343 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  36.14 
 
 
324 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
351 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  38.86 
 
 
361 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  37.44 
 
 
368 aa  88.6  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  39.29 
 
 
318 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  36.84 
 
 
361 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.29 
 
 
318 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  34.18 
 
 
305 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  40.84 
 
 
270 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  34.65 
 
 
348 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  38.78 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  37.69 
 
 
305 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  35.39 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  35.18 
 
 
376 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  34.02 
 
 
347 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  40.84 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  36.13 
 
 
320 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  37.17 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  38.46 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  36.32 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  32.62 
 
 
302 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  27.92 
 
 
263 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  35.84 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  31.43 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  32.11 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  31.25 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.79 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  32.2 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  23.98 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.2 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.2 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  36.52 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  28.79 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  21.93 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.1 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  28.1 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.09 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  31.64 
 
 
267 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  36.81 
 
 
240 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  36.26 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  32.78 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.77 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  31.07 
 
 
235 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  31.07 
 
 
235 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.22 
 
 
234 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  32.47 
 
 
264 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  31.07 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.6 
 
 
258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  24.29 
 
 
264 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.92 
 
 
270 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  24.86 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  21.65 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  30.26 
 
 
273 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  31.48 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2673  lipolytic protein G-D-S-L family  31.82 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  28.21 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  28.72 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  24.89 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  30.69 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  30 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  28.19 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.43 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  29.05 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5524  putative lipase/acylhydrolase  24.03 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  29.05 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  29.29 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  27.23 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  30.17 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  25.39 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  33.61 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.77 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  29.84 
 
 
233 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  30.43 
 
 
300 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.95 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1718  lipolytic protein G-D-S-L family  34.21 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  24.12 
 
 
255 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  25.12 
 
 
280 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 
319 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4054  hypothetical protein  39.08 
 
 
288 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  32.34 
 
 
333 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.51 
 
 
223 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  25.64 
 
 
283 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  25.52 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>