18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1718 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1718  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4054  hypothetical protein  59.64 
 
 
288 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2652  lipolytic protein G-D-S-L family  46.95 
 
 
287 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7486  hypothetical protein  53.57 
 
 
271 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1739  GDSL family lipase  48.95 
 
 
284 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241667  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3306  lipolytic protein G-D-S-L family  43.15 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0384478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1996  GDSL family lipase  39.59 
 
 
375 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2092  hypothetical protein  27.14 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2007  hypothetical protein  26.3 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1788  hypothetical protein  23.57 
 
 
427 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1853  hypothetical protein  26.39 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  28.7 
 
 
361 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.79 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
348 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  38.71 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  29.73 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  29.12 
 
 
361 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  36.59 
 
 
348 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>