More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1601 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  100 
 
 		 261 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  57.68 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  48.54 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  49.12 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  50 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  48.32 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.06 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  41.53 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  34.01 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  34.41 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.12 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  42.79 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  48.84 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  41.62 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11820  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  48.17 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00325557  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35.22 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  40.37 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  37.95 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.04 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  40.72 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  34.63 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.91 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  39.53 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  31.88 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  44.35 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.72 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  32.31 
 
 		 236 aa  145  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  32.11 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.22 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  36.05 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  36.05 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.44 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.56 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  28.7 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  35.16 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.04 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.73 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  45.54 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.89 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.57 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  43.75 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.25 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  34.38 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  39.58 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  35.62 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  36.84 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  39.83 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.82 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  33.17 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  41.85 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.16 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  41.85 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  36.87 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  38.02 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.29 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  31.58 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  36.12 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  40 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  35.91 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  35.59 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  37.22 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  36.49 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.36 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  42.11 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.04 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>