67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1428 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 384 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  36.29 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  35.14 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  36.95 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  26.1 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  26.61 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  26.98 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  26.7 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  26.7 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.35 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.67 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.37 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.65 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.84 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.84 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.51 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.92 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  24.12 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.42 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.11 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  21.78 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.27 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  29.36 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>