More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1397 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  72.11 
 
 
197 aa  284  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  72.87 
 
 
212 aa  275  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  71.43 
 
 
201 aa  275  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3572  Resolvase domain protein  73.02 
 
 
213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000252709  hitchhiker  0.00189094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  72.87 
 
 
194 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  64.89 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  63.77 
 
 
147 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 
191 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  42.93 
 
 
198 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 
188 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  41.58 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  41.58 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  41.58 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.34 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  40.32 
 
 
188 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.97 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 
224 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  39.36 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 
194 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.69 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.36 
 
 
197 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.01 
 
 
184 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.34 
 
 
192 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.7 
 
 
184 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  38.97 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.54 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  38.38 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.38 
 
 
196 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  39.57 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 
185 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.61 
 
 
189 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 
189 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 
185 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 
185 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 
185 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
184 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  38.02 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.81 
 
 
188 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.1 
 
 
188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  34.78 
 
 
186 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  44.62 
 
 
197 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.46 
 
 
205 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.46 
 
 
205 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.43 
 
 
181 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  40.22 
 
 
214 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.3 
 
 
187 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.68 
 
 
219 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
188 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
186 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
189 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 
200 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.5 
 
 
188 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  39.57 
 
 
186 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  41.11 
 
 
184 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
188 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
201 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
201 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.34 
 
 
185 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.34 
 
 
185 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  41.94 
 
 
281 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.56 
 
 
235 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.51 
 
 
197 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.78 
 
 
184 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.51 
 
 
196 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.51 
 
 
198 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 
192 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  33.33 
 
 
183 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  33.33 
 
 
183 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 
206 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
180 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
186 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
186 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  39.67 
 
 
186 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.69 
 
 
199 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.56 
 
 
190 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.25 
 
 
204 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
180 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.5 
 
 
203 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  39.04 
 
 
186 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.25 
 
 
204 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  37.23 
 
 
196 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
189 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 
184 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 
191 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
195 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
189 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.89 
 
 
194 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.08 
 
 
218 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 
185 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>