94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0647 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  63.71 
 
 		 510 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 528 aa  1061    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  63.44 
 
 		 500 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.05 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.58 
 
 		 525 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.58 
 
 		 525 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.45 
 
 		 496 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  53.85 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.67 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.17 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.25 
 
 		 502 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.08 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  38.31 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.05 
 
 		 508 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.25 
 
 		 512 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.53 
 
 		 497 aa  306  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.12 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.28 
 
 		 534 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.71 
 
 		 510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.54 
 
 		 508 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.64 
 
 		 508 aa  299  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.49 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.96 
 
 		 524 aa  296  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.83 
 
 		 511 aa  296  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.16 
 
 		 508 aa  293  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.09 
 
 		 522 aa  290  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.22 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  42.09 
 
 		 524 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.13 
 
 		 508 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.34 
 
 		 513 aa  280  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.38 
 
 		 533 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.74 
 
 		 532 aa  279  8e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.63 
 
 		 508 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  39.7 
 
 		 508 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.18 
 
 		 525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.7 
 
 		 510 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.69 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.57 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  34.29 
 
 		 512 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.48 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  37.69 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  35.53 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  40.92 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.84 
 
 		 520 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  35.68 
 
 		 508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  35.2 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.6 
 
 		 498 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.68 
 
 		 508 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  34.88 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.43 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  34.08 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.48 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.45 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.87 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.15 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.15 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  32.48 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.98 
 
 		 521 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  33.94 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  36.21 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.5 
 
 		 492 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.54 
 
 		 522 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.84 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  35.98 
 
 		 521 aa  236  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.07 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  36.58 
 
 		 569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.65 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.11 
 
 		 503 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.56 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.93 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  36.77 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.65 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.13 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  29.05 
 
 		 496 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  34.86 
 
 		 523 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.79 
 
 		 531 aa  217  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.02 
 
 		 532 aa  213  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  28.43 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  28.95 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.79 
 
 		 519 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.01 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  28.16 
 
 		 496 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  34.95 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.42 
 
 		 537 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  31.82 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  29.94 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  29.38 
 
 		 496 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  47.52 
 
 		 186 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.27 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.43 
 
 		 298 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.3 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.73 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  26 
 
 		 270 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  23.72 
 
 		 303 aa  43.9  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>