More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2020 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1077    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  44.69 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 533 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  43.64 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  43.98 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 608 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 529 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  39.06 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  40.39 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 529 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 		 524 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  38.64 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 522 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  39.38 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  40.74 
 
 		 527 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 523 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 514 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 509 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 526 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  32.01 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  30.4 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 497 aa  233  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  28.86 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 513 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.87 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 517 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 530 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.82 
 
 		 510 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 495 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 520 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 561 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  30.08 
 
 		 1470 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  30.08 
 
 		 1470 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 511 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 731 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  28.88 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  30.41 
 
 		 1518 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  29.07 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>