More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5028 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 507 aa  1023    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 515 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 514 aa  277  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 512 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 538 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.02 
 
 		 532 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.45 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 505 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 531 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 505 aa  183  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.68 
 
 		 529 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 559 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 691 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  29.5 
 
 		 536 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 662 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.09 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 564 aa  169  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 573 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.69 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 595 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  27.08 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.61 
 
 		 572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 		 561 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 		 510 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  26.86 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  26.86 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 582 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.52 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.93 
 
 		 561 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.65 
 
 		 510 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 		 496 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.78 
 
 		 510 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.94 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.13 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.47 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.48 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 530 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.71 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  26.89 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  28.83 
 
 		 539 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 505 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>