More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1247 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  71.35 
 
 		 176 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  69.87 
 
 		 171 aa  233  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  71.34 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  72.55 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  69.28 
 
 		 164 aa  224  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  69.28 
 
 		 164 aa  224  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  64.1 
 
 		 161 aa  207  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  52.33 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.94 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.74 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  51.74 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  51.16 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  52 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  50.58 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  52 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 		 162 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  47.19 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  51.92 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.19 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.29 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  51.92 
 
 		 194 aa  157  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  51.74 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  51.74 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  51.74 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  51.16 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  58.78 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  48.77 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  50.89 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 275 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 284 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  50.66 
 
 		 182 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  50.57 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  49.42 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  52 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  47.27 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  55.06 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  55.3 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  55.06 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  55.06 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.75 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  47.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  47.25 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 		 180 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.3 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  55.35 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  53.5 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  46.86 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  46.29 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  47.9 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  52.5 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>