More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0490 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  67.32 
 
 
257 aa  352  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  70.08 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  70.92 
 
 
256 aa  341  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  71.6 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  46.4 
 
 
256 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  41.6 
 
 
258 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  38.98 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  40.16 
 
 
257 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  42.79 
 
 
249 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.04 
 
 
260 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.02 
 
 
263 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.02 
 
 
263 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  40.51 
 
 
263 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  38.25 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  36.25 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  36.25 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  40.17 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  37.94 
 
 
256 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  38.39 
 
 
260 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  39.46 
 
 
257 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 
260 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  40.87 
 
 
260 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  39.74 
 
 
248 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  39.04 
 
 
261 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  40.64 
 
 
270 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  39.44 
 
 
261 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
251 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  44.13 
 
 
250 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  38.84 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  35.46 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  38.84 
 
 
251 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  37.25 
 
 
258 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  37.04 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  37.07 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.6 
 
 
260 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  37.21 
 
 
264 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  36.03 
 
 
264 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  41.15 
 
 
257 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  41.59 
 
 
266 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  34.41 
 
 
257 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.52 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.52 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  36.91 
 
 
252 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  38.43 
 
 
271 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  41.35 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  37.39 
 
 
267 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  35.55 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  39.01 
 
 
259 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  39.04 
 
 
269 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  37.33 
 
 
245 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  40.79 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.61 
 
 
270 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  39.57 
 
 
265 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  38.64 
 
 
265 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  36.09 
 
 
260 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  33.86 
 
 
268 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  38.89 
 
 
260 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  38.96 
 
 
260 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  38.96 
 
 
260 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  36.15 
 
 
255 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  35.83 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  38.35 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  36.99 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  38.64 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  36.02 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  39.17 
 
 
253 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  39.17 
 
 
388 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  37.39 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.37 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  37.39 
 
 
258 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  41.26 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  37.56 
 
 
260 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  39.01 
 
 
262 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  41.15 
 
 
250 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  37.18 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  36.14 
 
 
264 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  37.18 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  37.75 
 
 
370 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  38.76 
 
 
260 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  33.2 
 
 
269 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  40.29 
 
 
265 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.4 
 
 
374 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  37.5 
 
 
376 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  34.65 
 
 
383 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  33.86 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.4 
 
 
374 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  36.23 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  39.62 
 
 
265 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  38.39 
 
 
265 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  39.62 
 
 
265 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  38.6 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  38.43 
 
 
366 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  37.12 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  34.82 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  37.25 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  37.25 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  36.65 
 
 
260 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>