37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1248 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 888 aa  1686    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.49 
 
 		 880 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  30.09 
 
 		 878 aa  194  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  28.81 
 
 		 875 aa  181  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  29.9 
 
 		 880 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  32.07 
 
 		 875 aa  168  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 		 880 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  35.02 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  35.02 
 
 		 873 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  28.11 
 
 		 917 aa  107  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  37.37 
 
 		 875 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  28.31 
 
 		 874 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  28.73 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  43.55 
 
 		 870 aa  94.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  35.47 
 
 		 874 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  40.17 
 
 		 878 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  32.3 
 
 		 892 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  22.67 
 
 		 918 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  32.5 
 
 		 910 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  30.93 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  28.96 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  38.96 
 
 		 885 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  33.61 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  31.93 
 
 		 883 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  36.23 
 
 		 712 aa  54.3  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  27.69 
 
 		 877 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.96 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  27.69 
 
 		 877 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  34.78 
 
 		 955 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  29.28 
 
 		 877 aa  51.2  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  27.18 
 
 		 877 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  31.82 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  31.36 
 
 		 917 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1160 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1137 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  38.46 
 
 		 968 aa  44.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>