43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4483 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  780    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  50.93 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  51.55 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  52.72 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  51.65 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  51.65 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  51.65 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  48.66 
 
 		 396 aa  312  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  35.19 
 
 		 843 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  39.66 
 
 		 783 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25.85 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  33.85 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.31 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  27.56 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  24.62 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  30.19 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.35 
 
 		 801 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  41 
 
 		 773 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  38.14 
 
 		 792 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  39.18 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  23.33 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  26.09 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  29.73 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  33.82 
 
 		 809 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  25 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  23.55 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  23.81 
 
 		 916 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.01 
 
 		 340 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.19 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.57 
 
 		 847 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.03 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  29.76 
 
 		 851 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  31.29 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  31.07 
 
 		 811 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  24.37 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  31.33 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.17 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  31.96 
 
 		 854 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  28.48 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.05 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>