225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3418 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3418  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
166 aa  338  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4751  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 
168 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  54.04 
 
 
167 aa  184  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2004  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.38 
 
 
163 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13022  oxidoreductase  49.24 
 
 
204 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2400  putative oxidoreductase  47.62 
 
 
112 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  29.17 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  30 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  27.14 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1583  flavin reductase domain-containing protein  28.18 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.06 
 
 
184 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.69 
 
 
229 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.85 
 
 
216 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  29.41 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1583  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.45 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00544341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  26.43 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  25.69 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  26.43 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.4 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.26 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  25.71 
 
 
216 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  28.79 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  25.38 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.5 
 
 
311 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  24.59 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.54 
 
 
193 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
323 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  26.89 
 
 
311 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  25.71 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
226 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  23.53 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  27.27 
 
 
186 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  30.08 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  21.05 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.82 
 
 
180 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  21.05 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  28.97 
 
 
306 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  30.63 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  30 
 
 
430 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  26.19 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
393 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  27.78 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  30.21 
 
 
318 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  24.29 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  24.39 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  27.13 
 
 
302 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  26.43 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 
316 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  22.83 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  24.48 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  23.42 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.24 
 
 
170 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.79 
 
 
311 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
320 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  25.77 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.93 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  21.49 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.97 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
311 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  27.18 
 
 
346 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  28.36 
 
 
327 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.19 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  28.37 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  26.98 
 
 
597 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.69 
 
 
330 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  28.37 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
304 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.88 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  25.64 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  25.33 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  24.79 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  27.19 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  29.46 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  27.74 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.26 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  26.72 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  26.72 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.19 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  26.72 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  24.24 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>