30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2400 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2400  putative oxidoreductase  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3418  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.62 
 
 
166 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4751  flavin reductase domain-containing protein  50.98 
 
 
168 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  49.5 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2004  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13022  oxidoreductase  46.25 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.67 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  31.73 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
226 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
226 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  30.99 
 
 
191 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48766  predicted protein  28.57 
 
 
239 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.11 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
302 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.03 
 
 
170 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  29.79 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  31.88 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  37.08 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 
311 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  28.57 
 
 
170 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  25.3 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  25.3 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.78 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.69 
 
 
311 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>