More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1799 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  62.75 
 
 		 575 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  60.99 
 
 		 578 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 582 aa  1170    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  76.03 
 
 		 585 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  63.2 
 
 		 569 aa  663    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  71.95 
 
 		 579 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  76.37 
 
 		 576 aa  816    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  61.39 
 
 		 577 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  68.01 
 
 		 579 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  78.45 
 
 		 579 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  78.45 
 
 		 579 aa  846    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  78.45 
 
 		 581 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  73 
 
 		 587 aa  797    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  78.45 
 
 		 579 aa  846    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  78.95 
 
 		 585 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  59.75 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  59.07 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  60.73 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  61.24 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 		 552 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.29 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  57.48 
 
 		 574 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.39 
 
 		 567 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  57.32 
 
 		 583 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 		 574 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.41 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 579 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  56.84 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  57.87 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 603 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  53.64 
 
 		 639 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.08 
 
 		 585 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  52.39 
 
 		 582 aa  525  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  51.14 
 
 		 582 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  51.64 
 
 		 603 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.37 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  50.36 
 
 		 582 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 		 582 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.53 
 
 		 583 aa  478  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  46.85 
 
 		 562 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 581 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.29 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.48 
 
 		 532 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 531 aa  290  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.91 
 
 		 530 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 		 525 aa  286  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 559 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 537 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.39 
 
 		 545 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 534 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 525 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 532 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 559 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.76 
 
 		 700 aa  264  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 528 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 519 aa  262  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 556 aa  262  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 557 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 540 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.5 
 
 		 557 aa  260  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 573 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 524 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 543 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  34.23 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.7 
 
 		 495 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 545 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.23 
 
 		 522 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 564 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 560 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.5 
 
 		 491 aa  246  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>