More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2480 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2480  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 661 aa  1337    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1739  peptidase M48 Ste24p  87.75 
 
 		 661 aa  1109    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0245  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 		 655 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1527  peptidase M48 Ste24p  39.35 
 
 		 613 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0376313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  37.7 
 
 		 664 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1831  peptidase M48, Ste24p  37.74 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  38.92 
 
 		 657 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  36.61 
 
 		 659 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1608  peptidase M48 Ste24p  37.96 
 
 		 654 aa  350  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  37.7 
 
 		 672 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000295  Zn-dependent protease with chaperone function  35.03 
 
 		 629 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000240475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5171  peptidase M48 Ste24p  34.03 
 
 		 658 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3384  peptidase M48 Ste24p  39.06 
 
 		 673 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3448  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3305  peptidase M48, Ste24p  38.09 
 
 		 663 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  50.42 
 
 		 631 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3637  peptidase M48, Ste24p  38.44 
 
 		 339 aa  191  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.086452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4439  peptidase M48, Ste24p  41.07 
 
 		 335 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  33.86 
 
 		 299 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  40.79 
 
 		 319 aa  134  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  38.5 
 
 		 304 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  38.91 
 
 		 396 aa  132  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  37 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  29.6 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  36.36 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3529  HtpX-2 peptidase  29.5 
 
 		 294 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  30.34 
 
 		 330 aa  122  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  37.38 
 
 		 282 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  39.35 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  35.59 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  36.28 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  34.04 
 
 		 286 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 		 285 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  33.49 
 
 		 296 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  36.15 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  30.6 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  30.6 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  30.6 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  36.87 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  34.68 
 
 		 287 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  36.57 
 
 		 285 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  31.69 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  36.41 
 
 		 289 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  35.81 
 
 		 287 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1565  HtpX-2 peptidase  31.45 
 
 		 339 aa  107  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.411049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 285 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  32.63 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  36.04 
 
 		 307 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  35.87 
 
 		 307 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  33.75 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0242  heat shock protein HtpX  32.74 
 
 		 298 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  35.86 
 
 		 287 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  35.43 
 
 		 307 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  36.36 
 
 		 285 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 		 296 aa  104  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 		 280 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 		 280 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0429  heat shock protein HtpX  29.17 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  33.64 
 
 		 283 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  35.71 
 
 		 306 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 		 286 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  35.27 
 
 		 292 aa  101  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 		 286 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0503  peptidase M48 Ste24p  35.35 
 
 		 299 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  32.3 
 
 		 292 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  35.06 
 
 		 285 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0453  heat shock protein HtpX  32.07 
 
 		 339 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0640  heat shock protein HtpX  32.14 
 
 		 297 aa  100  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  30.86 
 
 		 296 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  29.07 
 
 		 396 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  30 
 
 		 287 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 293 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  33.48 
 
 		 290 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  34.63 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  32.9 
 
 		 281 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  35.93 
 
 		 285 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 		 284 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  34.53 
 
 		 280 aa  99  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  35.05 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 		 280 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  33.92 
 
 		 296 aa  98.2  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  27.49 
 
 		 305 aa  98.2  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  32.09 
 
 		 279 aa  97.8  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.58 
 
 		 286 aa  97.8  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 		 281 aa  97.8  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 		 283 aa  97.8  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  31.56 
 
 		 303 aa  97.8  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  36.11 
 
 		 285 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  34.88 
 
 		 315 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  33.18 
 
 		 279 aa  97.4  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 		 308 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  33.79 
 
 		 279 aa  97.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>