More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1790 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1790  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 380 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.44 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.54 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  26.14 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4235  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0474361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4086  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  25.73 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.43 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  31.03 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  24.42 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4210  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  41.38 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  50.82 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  22.58 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  47.37 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25.36 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  27.09 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  34.21 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  34.21 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  34.21 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0757  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  26.73 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  27.67 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 904 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25 
 
 		 935 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3700  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.59 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.2 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  25.35 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  30.23 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  25.37 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.79 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.53 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  48.15 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  23.5 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  48.15 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  32.71 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  44.26 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 507 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.01 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  27.21 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 		 656 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  37.08 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  26.52 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>