More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0961 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  100 
 
 		 144 aa  282  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  100 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  72.73 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  82.57 
 
 		 184 aa  191  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  69.44 
 
 		 175 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  74.07 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  79.59 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  68.7 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  69.07 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  65.98 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  56.64 
 
 		 229 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  52.94 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  67.01 
 
 		 208 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  68.04 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  65.66 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2303  ribosomal protein L17  63.27 
 
 		 113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0265603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  58.18 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  48.12 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  55.65 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  61 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  56.73 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  56.36 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  60.82 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  56.73 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  58.18 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  58.18 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  57.27 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  62.89 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  62.89 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  56.36 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  56.14 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  48.63 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  57.55 
 
 		 190 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0135  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  55.77 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  61.22 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  48.06 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  58.16 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  52.21 
 
 		 268 aa  124  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  56.19 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  49.31 
 
 		 196 aa  123  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  59 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  52.86 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 176 aa  120  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  55.77 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  54.81 
 
 		 206 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  49.24 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  56.6 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  58.42 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  55.77 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  54.81 
 
 		 139 aa  119  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  56 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  56.12 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  56.12 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  54.39 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  54.08 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  54.81 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  50.91 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1939  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  50.96 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0085  50S ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0996581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  54.81 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  56.12 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  58.76 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>