103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0806 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.93 
 
 		 290 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  71.72 
 
 		 290 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  71.03 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  58.28 
 
 		 290 aa  341  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  29.79 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  30.33 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  29.11 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  29.83 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  29.1 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  27.18 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  26.39 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  28.19 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  26.39 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  26.39 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  28.77 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  27.24 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  29.1 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  25.26 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  25.26 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  26.96 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  28.11 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  27.02 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  28.67 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  25.61 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  26.03 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  26.03 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  26.03 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  26.03 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  26.53 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  26.62 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  24.91 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  26.13 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  28.33 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  26.41 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  26.13 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  25.95 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  26.99 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  25.26 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  25.17 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  23.81 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  25.08 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  24.57 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  23.96 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  24.83 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  24.81 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  25.44 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  23.76 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  23.81 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  24.91 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  21.45 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  24.83 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  27.63 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  23.4 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  27.3 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  26.94 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  27.3 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  26.6 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  26.82 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  27.03 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  23.84 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  24.57 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  26.2 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  26.5 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  25.76 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  25.08 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  22.58 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  26.03 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  23.4 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  24.03 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  20.96 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  24.58 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  24.77 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  20.48 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  22.66 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  22.81 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  22.81 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2525  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.482024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>