More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2809 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  889    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1473  histidine kinase  61.95 
 
 
422 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1874  sensor histidine kinase  35.85 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3163  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
438 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.586022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2906  two-component sensor histidine kinase  33.25 
 
 
438 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000800194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1669  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
432 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1802  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
432 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1651  sensor histidine kinase  35.37 
 
 
432 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1849  sensor histidine kinase  35.37 
 
 
429 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113723 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1616  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2856  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3141  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3170  sensor histidine kinase  33.25 
 
 
438 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3528  sensor histidine kinase  35.37 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.728702  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1923  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1667  histidine kinase  34.88 
 
 
429 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1813  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2098  sensor histidine kinase  39.11 
 
 
263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2930  two-component sensor histidine kinase, C-terminus  42.02 
 
 
200 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.003022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2127  sensor histidine kinase  23.81 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  32 
 
 
591 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  38.71 
 
 
484 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2931  two-component sensor histidine kinase, N-terminus  27.09 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0392249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  33.86 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
979 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  38.89 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  40.48 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
680 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.15 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
745 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
689 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  35.97 
 
 
566 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
671 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
488 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  35.19 
 
 
608 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.10547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  39.81 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  39.81 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  39.81 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  33.8 
 
 
485 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  37.27 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  40.95 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  37.93 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  39.62 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
680 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  29.61 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
683 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
581 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
901 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  28.65 
 
 
553 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  41.67 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.15 
 
 
745 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  39.42 
 
 
458 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
827 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  40.95 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  40.95 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  40.95 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  40.95 
 
 
389 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  34.62 
 
 
745 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  40.95 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  40.95 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  36.22 
 
 
975 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
714 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.89 
 
 
529 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
1021 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  39.42 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1127 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  35.29 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  36.13 
 
 
533 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  36.13 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  31.74 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
557 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
567 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  38.94 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
602 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
536 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  38.46 
 
 
458 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  38.46 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>