245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1542 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  100 
 
 		 287 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  81.88 
 
 		 287 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  52.46 
 
 		 286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  51.41 
 
 		 286 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  51.41 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  50.35 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  50.7 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  51.06 
 
 		 286 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  50.7 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  43.17 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  42.05 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  45.55 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  42.45 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  41.43 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  42.14 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  37.59 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  38.81 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  35.23 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  37.76 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.17 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  37.59 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  35.99 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  36.52 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  34.62 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  37.5 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  33.22 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  34.39 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  31.69 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  32.04 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  32.87 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.12 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  31.45 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.94 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.99 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.57 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.62 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.43 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  32.27 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  32.16 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.64 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  33.69 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  32.39 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  32.27 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.66 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.85 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  30.63 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  31.8 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.87 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.93 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  29.93 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  30.34 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  30.28 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  31.29 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  31.12 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  31.29 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  32.87 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  32.38 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  31.12 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  26.76 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.76 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  31.62 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  31.27 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.52 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.82 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.82 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  30.94 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  32.03 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  29.68 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  29.68 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  29.68 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  29.68 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  29.68 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.47 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  31.65 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  30.18 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  29.54 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  30.5 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.29 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.79 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  32.73 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.98 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.3 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  32.39 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.93 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  28.57 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.98 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  28.88 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>