More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1473 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1473  histidine kinase  100 
 
 
422 aa  866    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.95 
 
 
431 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1874  sensor histidine kinase  36.02 
 
 
432 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1923  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
429 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1669  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
432 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1802  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
432 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3528  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
429 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.728702  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1616  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1849  sensor histidine kinase  36.04 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1667  histidine kinase  35.55 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3163  sensor histidine kinase  33.8 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.586022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1651  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2906  two-component sensor histidine kinase  33.8 
 
 
438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000800194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2856  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
438 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3170  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3141  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1813  sensor histidine kinase  34.6 
 
 
429 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2098  sensor histidine kinase  39.11 
 
 
263 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2930  two-component sensor histidine kinase, C-terminus  42.55 
 
 
200 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.003022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2127  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
431 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2931  two-component sensor histidine kinase, N-terminus  25.98 
 
 
219 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  36.55 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  44.04 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  32.98 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  37.27 
 
 
1400 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  38.32 
 
 
830 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  39.69 
 
 
859 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  30.99 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  38.32 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.28 
 
 
532 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.32 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
842 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
500 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
642 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
679 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
581 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  33.33 
 
 
591 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.91 
 
 
545 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
581 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.32 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
689 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  33.91 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  30.81 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
823 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  37.4 
 
 
858 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
467 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.61 
 
 
581 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
642 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
594 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
566 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  34.62 
 
 
591 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
622 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  31.41 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
544 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
611 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  27.88 
 
 
470 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
710 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
611 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
567 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
515 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
666 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.518725  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.81 
 
 
674 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  32.41 
 
 
475 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  38.89 
 
 
983 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  36.54 
 
 
628 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  37.5 
 
 
478 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
987 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
1195 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  36.52 
 
 
1187 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
501 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
661 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
633 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  35.85 
 
 
484 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1121 aa  64.3  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1199 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
832 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>