More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2447 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2765  Sel1 repeat-containing protein  64.85 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  38.24 
 
 		 368 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  44.09 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.31 
 
 		 438 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.38 
 
 		 684 aa  95.1  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.74 
 
 		 1402 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 172 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.48 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  40.32 
 
 		 393 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.84 
 
 		 831 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  38.33 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.55 
 
 		 490 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.52 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.74 
 
 		 789 aa  90.1  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.8 
 
 		 1002 aa  89.4  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.17 
 
 		 2413 aa  89  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 303 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.32 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40.87 
 
 		 961 aa  88.6  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.66 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 448 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.86 
 
 		 490 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.18 
 
 		 425 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.84 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  38.52 
 
 		 367 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.83 
 
 		 380 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.13 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 416 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.53 
 
 		 557 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  37.33 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.05 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.52 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.6 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  35.56 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1493 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  36.3 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.15 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.69 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  32.91 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  31.98 
 
 		 817 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  40.16 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  40.16 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  35.56 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.29 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.79 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.35 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.23 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.9 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40.35 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.88 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.88 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  47.87 
 
 		 680 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.77 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.96 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  40.37 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1037 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  39.64 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  40.88 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  37.01 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  37.01 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  37.82 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  37.01 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  37.01 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1032 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.88 
 
 		 838 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.86 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.96 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  37.96 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  38.79 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 976 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  38.58 
 
 		 839 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.59 
 
 		 731 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  44.66 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.32 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.57 
 
 		 679 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 		 890 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.48 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.65 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  40.48 
 
 		 961 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.94 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.71 
 
 		 685 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.12 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.15 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  34.4 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  43.12 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  28.76 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  41.74 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  38.94 
 
 		 839 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>