279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2043 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  79.92 
 
 		 259 aa  390  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  73.88 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  63.5 
 
 		 274 aa  344  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  62.77 
 
 		 274 aa  338  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  73.26 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  63.92 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  59.18 
 
 		 259 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  62.65 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  54.92 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  47.13 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  45.2 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  40.62 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  38.83 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  39.18 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  39.18 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  38.83 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  46.12 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  49.21 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  43.11 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  39.93 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  41.1 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  44.03 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  44.03 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  42.18 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.86 
 
 		 308 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  41.88 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.52 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  40.42 
 
 		 295 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.86 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  39.52 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  45.12 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  42.86 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  39.31 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  39.78 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  39.52 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.44 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  44.44 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  41.73 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  38.55 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  38.18 
 
 		 288 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.93 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  40.79 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  41.88 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  38.55 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  36.52 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  42.8 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  44.14 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  40 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.66 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  41.54 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  40.23 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  37.55 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.51 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  38.13 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  42.45 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  41.1 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  37.35 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  39.49 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  45.19 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  44.08 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  41.52 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0367  prepilin peptidase  38.7 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0600095  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  46.85 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.31 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.23 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  42.58 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  43.95 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  40.43 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  40 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  42.52 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3440  prepilin peptidase  37.93 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.823823  normal  0.0376305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1591  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.31 
 
 		 329 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  39.61 
 
 		 273 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.31 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  39.52 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  38.18 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  37.67 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  40.41 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  39.55 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  38.69 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  37.37 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  37.36 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  37.68 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  40.98 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.24 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  40.98 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.29 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0423  prepilin peptidase  38.19 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.71 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  40.07 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  37.63 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  36.63 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  39.85 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.07 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  36.97 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  38.49 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  41.22 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.49 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>