More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1868 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  100 
 
 		 380 aa  752    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  70.11 
 
 		 381 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  67.2 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  62.86 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  62.6 
 
 		 380 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  56.35 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  52.09 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  55 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  50.26 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  48.53 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  48.02 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  48.8 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  49.46 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  50 
 
 		 385 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  47.49 
 
 		 383 aa  355  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  43.88 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  44.85 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  48.67 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  45.77 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  42.13 
 
 		 379 aa  319  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  43.73 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  37.8 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  41.49 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  48.4 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  37.53 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  40.53 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  46.32 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  37.93 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  40.74 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  40.11 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  42.05 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  41.03 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  40.16 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  41.88 
 
 		 387 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  36.77 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  37.07 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.7 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  37.83 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.11 
 
 		 885 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.09 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  37.73 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  36.75 
 
 		 879 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 376 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  37.2 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 878 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.12 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  35.17 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.6 
 
 		 880 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.55 
 
 		 896 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  36.22 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.03 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.69 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  36.53 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.92 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.28 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.26 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.5 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.18 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.9 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.86 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.76 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  31.62 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.95 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.26 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  34.86 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  29.61 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  32.99 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.78 
 
 		 572 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.76 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.77 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.77 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.38 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.82 
 
 		 419 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.44 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.5 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.43 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  32.38 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.58 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.75 
 
 		 441 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.31 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0399  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.31 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  32.99 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.42 
 
 		 673 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.61 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  32.35 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.54 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.7 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.97 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.7 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 		 429 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.78 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  34.28 
 
 		 425 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>