76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0108 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  100 
 
 		 141 aa  270  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  74.47 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  56.74 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  66.18 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  60.99 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.19 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  59.57 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.77 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.97 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.06 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.88 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.33 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.57 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  32.87 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.01 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.66 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  24.11 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  24.11 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  30.3 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.63 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  29.03 
 
 		 264 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.15 
 
 		 259 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 		 195 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.28 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.66 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.87 
 
 		 288 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  28.67 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.87 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  36.36 
 
 		 255 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  33.08 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4337  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.77 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00401798  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  33.83 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  26.95 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  39.47 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  26.49 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  25.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  31.75 
 
 		 167 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 		 193 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  24.31 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.05 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  38.1 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  39.29 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.47 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.12 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  33.08 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  29.08 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.48 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  32.06 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.9 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.9 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  29.05 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.68 
 
 		 176 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  23.94 
 
 		 165 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.83 
 
 		 140 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  26.75 
 
 		 164 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>