115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6712 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  36.04 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  32.59 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  31.34 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  33.8 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  35.51 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  30.93 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  22.44 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  21.63 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  21.95 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  21.95 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  30.19 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  21.46 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  21.46 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.34 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  20.98 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  24.52 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  22.82 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  39.45 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  25 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  29.25 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  23.18 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  26.27 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  21.1 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  31.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  25.52 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  25.52 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  25.34 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.41 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  24.5 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1575  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00527276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  24.66 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  36.51 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.68 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 575 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3450  methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  34.85 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  23 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  22.83 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  24.66 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  34 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  23.3 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  20.52 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  23.85 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.77 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 195 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  42 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 167 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  25.4 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  29.9 
 
 		 416 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  32.88 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  23.3 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  23.97 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>