More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6677 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6677  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  38.15 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.72 
 
 
431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  34.24 
 
 
432 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  33.16 
 
 
486 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  32.46 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  32.46 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  32.46 
 
 
436 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.84 
 
 
425 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
437 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.72 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  32.03 
 
 
436 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  32.57 
 
 
438 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.33 
 
 
424 aa  138  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  32.24 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  34.49 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  31.38 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  34.3 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.69 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  33.22 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  34.3 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  29.55 
 
 
451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  33.22 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
438 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
446 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.91 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  32.14 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  33.12 
 
 
437 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  31.49 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  34.64 
 
 
434 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.42 
 
 
447 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  31.05 
 
 
473 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.05 
 
 
473 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.05 
 
 
473 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.06 
 
 
467 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  30.46 
 
 
438 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  34.34 
 
 
438 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  31.21 
 
 
470 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.21 
 
 
470 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 
470 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  31.43 
 
 
467 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.01 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.87 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 
473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.79 
 
 
460 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  30.91 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.91 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  30.3 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.91 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  32.13 
 
 
440 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  30.16 
 
 
437 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.15 
 
 
428 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  32.89 
 
 
440 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  30.16 
 
 
437 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.67 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.91 
 
 
470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  31.63 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.23 
 
 
434 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  30.87 
 
 
466 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.03 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.22 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  29.18 
 
 
440 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  31.94 
 
 
436 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.43 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.94 
 
 
436 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.87 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.45 
 
 
475 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  33.43 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  32.53 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  33.43 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  32.79 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.45 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.57 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  31.94 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.25 
 
 
453 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  31.31 
 
 
466 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.35 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.35 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.35 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  33.13 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  33.43 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.55 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.9 
 
 
466 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.23 
 
 
466 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  30.55 
 
 
466 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.56 
 
 
437 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.56 
 
 
437 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.26 
 
 
466 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.26 
 
 
466 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.41 
 
 
435 aa  115  8.999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.04 
 
 
443 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.89 
 
 
441 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.12 
 
 
437 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  29.26 
 
 
466 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  30.84 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.35 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.03 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.17 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  31.48 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>