More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5443 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  100 
 
 
418 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  62.97 
 
 
412 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  62.53 
 
 
407 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  35.81 
 
 
406 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  36.92 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.93 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  32.74 
 
 
406 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  32.23 
 
 
421 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.86 
 
 
380 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.24 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  34.09 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.16 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  31.63 
 
 
399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  34.14 
 
 
390 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  31.16 
 
 
398 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.38 
 
 
401 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  30.42 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.38 
 
 
421 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  31.97 
 
 
397 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  31.54 
 
 
396 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  32.58 
 
 
399 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  35.69 
 
 
403 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  33.91 
 
 
415 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  34.11 
 
 
418 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  31.28 
 
 
450 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  33.33 
 
 
425 aa  186  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  34.13 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.61 
 
 
410 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  32.53 
 
 
387 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  31.46 
 
 
449 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.05 
 
 
392 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  36.21 
 
 
409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  34.13 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  34.13 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  33.9 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  33.8 
 
 
409 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  32.21 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  32.87 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  33.24 
 
 
412 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  33 
 
 
405 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  30.71 
 
 
447 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  31.83 
 
 
403 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  33 
 
 
405 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.4 
 
 
402 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.49 
 
 
404 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.09 
 
 
398 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.89 
 
 
401 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.38 
 
 
398 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.26 
 
 
403 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  32.58 
 
 
418 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  32.58 
 
 
418 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  32.58 
 
 
418 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  31.1 
 
 
406 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  31.66 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.02 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  31.41 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.38 
 
 
406 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2305  cytochrome P450  31.25 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.378524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.75 
 
 
404 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.75 
 
 
404 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  30.66 
 
 
448 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  32.17 
 
 
393 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  30.29 
 
 
396 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  33.5 
 
 
418 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  29.29 
 
 
417 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  32.66 
 
 
410 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31.38 
 
 
398 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  30.47 
 
 
395 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  31.1 
 
 
418 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  32.69 
 
 
401 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.43 
 
 
407 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  30.75 
 
 
387 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  31.2 
 
 
404 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  31.62 
 
 
449 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  30.89 
 
 
414 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  32.22 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  33.05 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.24 
 
 
407 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  33.05 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  30.14 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  30.65 
 
 
416 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  30.65 
 
 
416 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  32.58 
 
 
417 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  29.38 
 
 
424 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  30.65 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.69 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34.41 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  29.86 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.21 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  29.46 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  29.78 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.69 
 
 
395 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  28.42 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  30.98 
 
 
416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.36 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.44 
 
 
390 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.79 
 
 
401 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>