144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4934 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  517  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  53.85 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  56.74 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  49.6 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  51.09 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.19 
 
 		 235 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.67 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  54.46 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  44.26 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  44.26 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  44.26 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  54.91 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  46.72 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.61 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  45.89 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  44.39 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  46.26 
 
 		 374 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  47.44 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.4 
 
 		 376 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  43.56 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.21 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.39 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  42.39 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.85 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.7 
 
 		 371 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  47.58 
 
 		 371 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  45.41 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.43 
 
 		 233 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  40.61 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  39.48 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  41.33 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  41.96 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  41.51 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  39.66 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  41.05 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  39.82 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  34.5 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  39.48 
 
 		 229 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.89 
 
 		 246 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  38.57 
 
 		 228 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.18 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  47.02 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  26.94 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  42.04 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  39.62 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.7 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.24 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  38.05 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  41.2 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  37.33 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  40.47 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.2 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  28.46 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  42.11 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  42.15 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  39.22 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  37.83 
 
 		 387 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  40.27 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  43.5 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  37.1 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.28 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  42.59 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  38.95 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  42.41 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  45 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.91 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  39.41 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  45.4 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  32.09 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.5 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  33.48 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  36.8 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  35 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  36 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  29.89 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  34.93 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.09 
 
 		 401 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.54 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  47.06 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.58 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  32.56 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  31.11 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  30.53 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  39.25 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.79 
 
 		 360 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  47.79 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.57 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  45.57 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  27.04 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  29.05 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.04 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.03 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  28.37 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.7 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>