More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4859 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  100 
 
 
281 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  65.58 
 
 
291 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  65.58 
 
 
291 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  65.58 
 
 
291 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  65.58 
 
 
291 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  65.58 
 
 
291 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  65.22 
 
 
291 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  62.85 
 
 
305 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  65.25 
 
 
283 aa  344  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  62.73 
 
 
282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  60.36 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  61.45 
 
 
282 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  61.45 
 
 
282 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  63.27 
 
 
282 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  60 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  61.82 
 
 
282 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  53.48 
 
 
280 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  57.46 
 
 
285 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  49.29 
 
 
275 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.22 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  40.36 
 
 
285 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  40.28 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 
282 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
285 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  40.07 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  33.22 
 
 
325 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  43.97 
 
 
240 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  39.07 
 
 
287 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  38.73 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.67 
 
 
290 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  40.07 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 
287 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
285 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.75 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.89 
 
 
283 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  40.25 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  37.14 
 
 
275 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
290 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  36.74 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
281 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  38.22 
 
 
270 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  33.51 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  29.25 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.25 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  41.61 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
526 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  34.36 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  34.9 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  20.85 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.59 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.51 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.59 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.89 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.86 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  40.8 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.87 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.29 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.04 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.39 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
176 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.12 
 
 
233 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.44 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>