More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4614 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  100 
 
 
398 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  66.92 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.16 
 
 
393 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  63.61 
 
 
389 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  63.73 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  63.73 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  63.13 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  64.34 
 
 
393 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  61.1 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  59.15 
 
 
425 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  61.21 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  57.61 
 
 
386 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  61.22 
 
 
368 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
388 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  56.6 
 
 
399 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  56.63 
 
 
387 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  56.35 
 
 
409 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  56.36 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  56.09 
 
 
421 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  57.22 
 
 
431 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
409 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  53.25 
 
 
426 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  57.54 
 
 
418 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  55.86 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.15 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
370 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.94 
 
 
368 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.02 
 
 
370 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  52.58 
 
 
380 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  52.55 
 
 
375 aa  385  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
369 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.98 
 
 
369 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.87 
 
 
370 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
406 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
375 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.52 
 
 
374 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.31 
 
 
380 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  52.53 
 
 
366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.81 
 
 
366 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  52.55 
 
 
405 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.62 
 
 
369 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.82 
 
 
410 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  54.06 
 
 
371 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.51 
 
 
398 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  53.94 
 
 
388 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  53.12 
 
 
404 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.14 
 
 
372 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 
376 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  52.88 
 
 
375 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.51 
 
 
370 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50 
 
 
367 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  51.91 
 
 
382 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.62 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50 
 
 
367 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.5 
 
 
366 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.39 
 
 
367 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.5 
 
 
366 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.64 
 
 
367 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.62 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.01 
 
 
370 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  52.54 
 
 
404 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.34 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.21 
 
 
366 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  52.16 
 
 
381 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
370 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  52 
 
 
416 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  49.23 
 
 
367 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.1 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
374 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.17 
 
 
402 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
364 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  50.25 
 
 
366 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 
379 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  49.5 
 
 
378 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  53.75 
 
 
370 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.26 
 
 
366 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 
377 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.11 
 
 
367 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.91 
 
 
360 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  51.63 
 
 
388 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  51.75 
 
 
408 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  48.98 
 
 
364 aa  357  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.38 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.45 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  48.98 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.13 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  50.64 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.73 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  50.38 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.87 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>