135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4331 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 451 aa  901    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  65.95 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.6 
 
 		 771 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 413 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  48.04 
 
 		 413 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  47.77 
 
 		 413 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  46.18 
 
 		 400 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  44.71 
 
 		 761 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.73 
 
 		 771 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.83 
 
 		 764 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 		 776 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.33 
 
 		 792 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.33 
 
 		 792 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.11 
 
 		 785 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.39 
 
 		 791 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.02 
 
 		 790 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.3 
 
 		 761 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.25 
 
 		 782 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.36 
 
 		 789 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.62 
 
 		 764 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.76 
 
 		 790 aa  236  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.83 
 
 		 777 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.98 
 
 		 790 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.45 
 
 		 775 aa  232  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.31 
 
 		 778 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.61 
 
 		 772 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.72 
 
 		 822 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.5 
 
 		 774 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.54 
 
 		 804 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.29 
 
 		 790 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.38 
 
 		 782 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.34 
 
 		 777 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.99 
 
 		 791 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  36.61 
 
 		 712 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  35.09 
 
 		 374 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  34.18 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.83 
 
 		 752 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  34.67 
 
 		 782 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.73 
 
 		 784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  34.39 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 		 381 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.22 
 
 		 780 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 386 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  33.86 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  31.93 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.05 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.17 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  30.08 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  25 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.2 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  28.03 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.41 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.62 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.68 
 
 		 369 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.53 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.53 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  23.67 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  22.85 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  23.67 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  27.88 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  25.83 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.05 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.35 
 
 		 374 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  26.71 
 
 		 374 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  25.36 
 
 		 399 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.52 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  24.46 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  23.32 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.86 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08199  MAK1-like monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12060)  29.3 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  25.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  24.6 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  26.39 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.03 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  23.03 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  25.62 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  22.87 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 380 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  23.77 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  27.08 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4419  kynurenine 3-monooxygenase  27.91 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  25.12 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 555 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>