More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4217 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 349 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  36.08 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.96 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  30.96 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.67 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4573  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.39 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  24.49 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  27.84 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15090  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4691  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  25.43 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  27.43 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.54 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.75 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.99 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  25.6 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.45 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.85 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6359  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  28.98 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6460  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0978202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.53 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6695  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.6 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  33.55 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.11 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  30.31 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  28.33 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1161  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6297  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0983  ribose operon repressor, putative  31.46 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  35.08 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.42 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  25.29 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1311  LacI family transcription regulator  31.73 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  32.67 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.89 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  26.57 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  33.65 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4566  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3341  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  28.42 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.38 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  29.87 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  28.42 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.38 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.86 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.38 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  25.41 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  25.74 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  25.41 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  28.08 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  26.97 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  28.52 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  27.84 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>