More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4126 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4126  HemK family modification methylase  100 
 
 		 305 aa  583  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5450  HemK family modification methylase  63 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00679911  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  63.26 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  58.51 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  58.72 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  53.79 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3032  HemK family modification methylase  53.76 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0413645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  55.47 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01420  putative methylase of HemK family  55.04 
 
 		 275 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6194  modification methylase, HemK family  57.2 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253909  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0482  modification methylase, HemK family  52.67 
 
 		 281 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  54.65 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  52.4 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1667  modification methylase, HemK family  53.57 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.50432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0906  modification methylase, HemK family  50.9 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1773  modification methylase, HemK family  44.65 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4332  modification methylase, HemK family  51.34 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0144105  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2622  modification methylase, HemK family  53.72 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1355  modification methylase, HemK family  40.98 
 
 		 264 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.495487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09490  putative methylase of HemK family  44.21 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38.79 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.48 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  40.49 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.15 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  39.2 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.08 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.97 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.62 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.84 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03501  putative protein methyltransferase  30.2 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  36.79 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  28.96 
 
 		 587 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.55 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.54 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  33.33 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  33.06 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  39.13 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.6 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3178  modification methylase, HemK family  32.64 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.43 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  31.66 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  37.4 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  36.21 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  31.45 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  28.7 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.45 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03421  putative protein methyltransferase  29.74 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.783711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.58 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  41.75 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.92 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  34.75 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  37.55 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  41.71 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  34.84 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.25 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.25 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  36.07 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  31.27 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.1 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.38 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.14 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  33.44 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.25 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.57 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.27 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  36.89 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.340756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  36.09 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  35.92 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2072  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1344  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3240  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2508  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.68 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0324  HemK family modification methylase  30 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.8 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.16 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  35.71 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2597  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.1 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  38.39 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  37.07 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.4 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  37.61 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1388  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.42 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  33.62 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 394 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  34.85 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  35.27 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  29.92 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.14 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>