More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3942 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  100 
 
 		 331 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  51.13 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  48.37 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  51.94 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  48.37 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  52.23 
 
 		 774 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  50 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  48.12 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  48.43 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  46.93 
 
 		 321 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  47.98 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  47.98 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  47.98 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.4 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  43.65 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  47.02 
 
 		 784 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  42.55 
 
 		 788 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  46.25 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  43.35 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  43.35 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  44.37 
 
 		 657 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  43.9 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  44.87 
 
 		 782 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  44.55 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  44.55 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  44.55 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  41.43 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  47.25 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  46.93 
 
 		 784 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  46.93 
 
 		 784 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  46.6 
 
 		 784 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  46.6 
 
 		 784 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  46.6 
 
 		 784 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  46.6 
 
 		 784 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  44.3 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  40.68 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  42.06 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  42.81 
 
 		 780 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  38.94 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  44.34 
 
 		 775 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  40.24 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  44.38 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  43.05 
 
 		 788 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.67 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  39.2 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  41.36 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  41.05 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  40.8 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  42.06 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  39.5 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  39.5 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.37 
 
 		 783 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  40.31 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  39.75 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  41.01 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  42.44 
 
 		 769 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.61 
 
 		 320 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  41.49 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  43.85 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  43.04 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.19 
 
 		 783 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.25 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  41.49 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  44.3 
 
 		 794 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  40.66 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  40.49 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.82 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  41.18 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  41.51 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  41.18 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.99 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  43.73 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  42.33 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  40.94 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  39.24 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  40.38 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  39.62 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  39.75 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.63 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  39.31 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  39.57 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  40.51 
 
 		 352 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  37.23 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  39.58 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  37.84 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  40.44 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  41.67 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.8 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.44 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.51 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  37.8 
 
 		 588 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.75 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  39.94 
 
 		 754 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.23 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  38.23 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  38.23 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  37.92 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  41.64 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.94 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.23 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>