More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3464 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3464  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 529 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  37.63 
 
 		 521 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 523 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  39.32 
 
 		 416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 		 519 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 520 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7148  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 531 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0874465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 525 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  31.56 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7529  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.57 
 
 		 541 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 517 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  28.9 
 
 		 523 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.34 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 518 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.79 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.82 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.11 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.4 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.6 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.2 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.2 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  30.67 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.2 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.12 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.57 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.88 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.67 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 512 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.06 
 
 		 517 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.68 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.68 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.68 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.8 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.43 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.43 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.44 
 
 		 509 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.88 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.07 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.06 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>